Dynamics of leaf physiology responses

For more info about our services contact : help@bestpfe.com

Table of contents

Chapitre 1 : Introduction
1. L’Ozone
1.1. L’O3 stratosphérique
1.2. L’O3 troposphérique
1.2.1. Origine de l’O3 dans la troposphère
1.2.2. Evolution des concentrations en O3 troposphérique
2. Conséquence pour les productions végétales : forêts et cultures
3. Seuils de risques à l’O3
3.1. Basé sur la concentration atmosphérique d’O3
3.2. Basé sur le flux d’O3 cumulé dans la feuille
4. Impact de l’O3 à l’échelle de la feuille
4.1. Mécanisme d’entrée de l’O3 dans la feuille
4.2. Emergence de symptômes visibles
4.2.1. Changement de pigmentation : rougissement, bronzing
4.2.2. Stippling, mottling, bleaching et nécrose
4.3. Changements microscopiques associés aux symptômes visibles
4.3.1. Changements microscopiques sous-jacents au changement de pigmentation
4.3.2. Changements microscopiques derrières les symptômes de type stippling, mottling, bleaching et nécroses
4.4. L’O3, éliciteur de la mort cellulaire programmée
4.4.1. L’O3 provoque une accélération de la senescence
4.4.2. Une mort cellulaire rapide : la réponse hypersensible-like
4.4.3. Rôles des phytohormones dans la PCD
4.5. Impact de l’O3 sur la physiologie
4.5.1. Réduction des processus photosynthétiques et des échanges gazeux
4.5.2. Augmentation de la respiration et inhibition de la photorespiration
4.6. Changements d’expression de gènes en réponse au stress O3
4.6.1. Baisse d’expression de gènes associés à la fixation de carbone
4.6.2. Stimulation de la voie des phénylpropanoïdes
4.6.3. Surexpression de gènes associés aux phytohormones et au système antioxydant
4.6.4. Expression de gènes relatifs à la mort cellulaire programmée
4.6.5 Etudes transcriptomiques globales : le RNAseq
5. Objectif du travail de thèse
5.1. Présentation des équipes rattachées au projet EFFECTO3-Flux
5.2. Contexte scientifique global
Chapitre 2 : Dynamique des réponses foliaires chez le peuplier en fonction de la dose d’O3 phytotoxique
Préface
Abstract
Introduction
Materials and methods
Plant material and controlled O3 exposure
Dynamics of leaf physiology responses and estimation of phytotoxic O3 dose
Dynamics of microscopic and visible leaf injury
Morphological assessments
Statistical analysis
Results
Morphological responses
Dynamics of leaf physiology responses
Dynamics of HR-like lesion spread and development
Emergence of visible symptoms
Discussion
Dynamics of physiological and structural responses to O3 stress
Leaf position dependency of responses to O3 stress
Reaction gradient in foliage in relation to critical O3 levels
Conclusion
Chapitre 3 : Dynamique des changements structuraux et ultrastructuraux induits par l’O3 dans les feuilles de peupliers
Préface
Abstract
Introduction
Materials & Methods
Plant material and O3 fumigation
Leaf physiology analysis
Structural and cytological analysis
Statistical analysis
Results
Dynamics of leaf responses
Structural ontology of HR-like lesion was not related to O3 exposure or leaf position
Dynamic of structural and ultra-structural changes related to ACS
Discussion
Contrast between HR-like and ACS
Leaf differences
Dynamics of HR-like and ACS microscopic changes in relation to O3 uptake
Supplemental material
Chapitre 4 : Sensibilité de la feuille de peuplier à l’O3 en fonction de l’âge : dynamique des changements transcriptomiques
Préface
Abstract
Introduction
Material and methods
Plant material and growth conditions
Experiment sampling
Leaf visible injury
HR-like lesion
Total chlorophyll content and LMA
Leaf gas exchange and estimation of POD0
RNA-extraction and sequencing
RNA-sequencing data processing
Identification of differentially expressed genes
Gene ontology analysis
Weighted gene co-expression network analysis
Results
Dynamics of structural injury and relative loss of chlorophyll content
Differential gene expression and GO enrichment
Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA)
DEG shared with autumnal senescence and autophagy in poplar
Correlation between gene expression and HR-like lesion
Discussion
Dynamics of transcriptomic changes in response to O3 stress
Leaf age and O3
Identification of molecular markers for O3 stress diagnosis
Supplemental material
Chapitre 5 : Synthèse générale
1. Deux dynamiques de réponses bien distinctes
1.1 Dynamique de la senescence
1.2 Dynamique de la réponse HR-like
1.3 Une forte dépendance des dynamiques aux conditions environnementales
2. L’importance du stade de développement foliaire dans la réponse à l’O3
3. Seuils de risques
Conclusions & perspectives
REFERENCES